RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3-208ENST00000489537 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 KRT79Q5XKE5 535 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 LUZP1Q86V48 1076 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 FBXO11Q86XK2 927 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 HOMER1Q86YM7 354 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 ERMNQ8TAM6 284 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 IQCDQ96DY2 449 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 AS3MTQ9HBK9 375 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 FEM1BQ9UK73 627 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.16□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 BICDL2A1A5D9 508 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 ADM5C9JUS6 153 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 PIK3CDO00329 1044 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 ZMYND10O75800 440 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 GH2P01242 217 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 TPM1P09493 284 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 GOLGA8HP0CJ92 632 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 MUTP22033 750 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 CAP2P40123 477 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 KCNJ6P48051 423 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 ZNF75DP51815 510 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 LBX1P52954 281 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 TERF1P54274 439 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 MORC3Q14149 939 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 INF2Q27J81 1249 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 LETM2Q2VYF4 491 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 TNS4Q8IZW8 715 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 TBCKQ8TEA7 893 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 DHX58Q96C10 678 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 FAM20AQ96MK3 541 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 CLIC6Q96NY7 704 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 VCPKMTQ9H867 229 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 VEZTQ9HBM0 779 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 DISC1Q9NRI5 854 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 ABCB11O95342 1321 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3A3-208ENST00000489537 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.15□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.15□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 TMEM232C9JQI7 657 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 SMIM22K7EJ46 135 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 WNT10BO00744 389 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 PSMA7O14818 248 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 DTNBO60941 627 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 SERPINC1P01008 464 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 MYH6P13533 1939 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 CYP3A7P24462 503 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 PSMD2Q13200 908 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 GRM1Q13255 1194 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 SPATA1Q5VX52 437 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 SV2BQ7L1I2 683 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 PAGE5Q96GU1 130 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 CAPNS2Q96L46 248 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3A3-208ENST00000489537 DNAJC18Q9H819 358 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms