RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480226.5

ITGB1-212, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-212ENST00000480226 K7ESM1 405 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB1-212ENST00000480226 KLF4O43474 513 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB1-212ENST00000480226 STAT5AP42229 794 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB1-212ENST00000480226 ITGA1P56199 1179 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB1-212ENST00000480226 EFEMP1Q12805 493 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB1-212ENST00000480226 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB1-212ENST00000480226 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB1-212ENST00000480226 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB1-212ENST00000480226 SYT3Q9BQG1 590 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB1-212ENST00000480226 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB1-212ENST00000480226 DGKIO75912 1065 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 LCP1P13796 627 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 MAP4K2Q12851 820 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 RGL3Q3MIN7 710 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 STEAP3Q658P3 488 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 STK32CQ86UX6 486 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 FAM124AQ86V42 546 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 C1orf159Q96HA4 380 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 ST7Q9NRC1 585 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 MAFKO60675 156 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 TADA3O75528 432 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 CAPNS1P04632 268 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 PPP2R2AP63151 447 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 CR1LQ2VPA4 569 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 EMC4Q5J8M3 183 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 A0A1W2PQU0 124 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 MROH6A6NGR9 719 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 GRIA2P42262 883 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 NFKB2Q00653 900 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 DDR2Q16832 855 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 MCTP2Q6DN12 878 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 BORAQ6PGQ7 559 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 LGI4Q8N135 537 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 SGSM3Q96HU1 749 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 IER2Q9BTL4 223 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 GPR27Q9NS67 375 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 DTLQ9NZJ0 730 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.347e-13■■■■□ 24.7
ITGB1-212ENST00000480226 CYP7B1O75881 506 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 ITGB3P05106 788 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 ZNF827Q17R98 1081 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 PRR31Q5SQ13 230 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 KRIT1O00522 736 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 ADAM9Q13443 819 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 USP53Q70EK8 1073 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 CLIC6Q96NY7 704 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 MYOTQ9UBF9 498 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 C9orf118A6NHY6 69 aa6.66□□□□□ -1.34
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ITGB1-212ENST00000480226 KRTAP10-2P60368 255 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 RAB33AQ14088 237 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 TEPPQ6URK8 271 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 WRNIP1Q96S55 665 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 JAG2Q9Y219 1238 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 PLATP00750 562 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 LRG1P02750 347 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 DCAF4Q8WV16 495 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 TMEM209Q96SK2 561 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 GPR20Q99678 358 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 INVSQ9Y283 1065 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB1-212ENST00000480226 FGFR1P11362 822 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGB1-212ENST00000480226 ZNF28P17035 718 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGB1-212ENST00000480226 IL13P35225 146 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGB1-212ENST00000480226 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ITGB1-212ENST00000480226 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ITGB1-212ENST00000480226 GGNQ86UU5 652 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGB1-212ENST00000480226 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ITGB1-212ENST00000480226 JAM3Q9BX67 310 aa6.64□□□□□ -1.35
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