RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299299.3

PCBD1-201, Transcript of pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCBD1, Length 1,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBD1-201ENST00000299299 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 TRAF1Q13077 416 aa15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 PXMP2Q9NR77 195 aa15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.48■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.47■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.47■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 ZEB2O60315 1214 aa15.47■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.47■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 COPS5Q92905 334 aa15.47■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 KIF3AQ9Y496 699 aa15.47■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 ESYT2A0FGR8 921 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 POLR2MP0CAP2 368 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 ITGB8P26012 769 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 CPT1AP50416 773 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 FOSBP53539 338 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 NAPAP54920 295 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 FAAP100Q0VG06 881 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 TTLL4Q14679 1199 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 SHHQ15465 462 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 NPY5RQ15761 445 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 IL31RAQ8NI17 732 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 BADQ92934 168 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 C8orf76Q96K31 380 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 TOX2Q96NM4 488 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 IWS1Q96ST2 819 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBD1-201ENST00000299299 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 ARVCFO00192 962 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 KIAA0355O15063 1070 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 ADAMTS3O15072 1205 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 CABYRO75952 493 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 PSMC6P62333 389 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 STXBP2Q15833 593 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 KRT40Q6A162 431 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 TBX21Q9UL17 535 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 SMCO2A6NFE2 343 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 NR3C2P08235 984 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 XBP1P17861 261 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 SYT1P21579 422 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 DDIT3P35638 169 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 CDK7P50613 346 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 GUCY1B3Q02153 619 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 PGM5Q15124 567 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 GRIN2DO15399 1336 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 MMP1P03956 469 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 MYL3P08590 195 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 FOSL2P15408 326 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 RAG1P15918 1043 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 PDCP20941 246 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 ADCY7P51828 1080 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 NLRP5P59047 1200 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 ITGA7Q13683 1181 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 TRIM29Q14134 588 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 LY6KQ17RY6 165 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 DAGLBQ8NCG7 672 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 MYLIPQ8WY64 445 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 C6orf50Q9HD87 102 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.43■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 M0R2N6 131 aa15.42■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 PIK3CDO00329 1044 aa15.42■□□□□ 0.06
PCBD1-201ENST00000299299 MEIS2O14770 477 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms