RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 RASSF10A6NK89 507 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAP2K7O14733 419 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZBTB5O15062 677 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 KRT86O43790 486 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TBC1D8O95759 1140 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 GNA14O95837 355 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 AKR1B1P15121 316 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 PRLRP16471 622 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 PDE6BP35913 854 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 AMPD2Q01433 879 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 DDR1Q08345 913 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 EHHADHQ08426 723 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAN2A1Q16706 1144 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM182BQ5T319 152 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 PODNQ7Z5L7 613 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 LRRC15Q8TF66 581 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 DCAF4Q8WV16 495 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TEKT1Q969V4 418 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 COA7Q96BR5 231 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 MBOAT7Q96N66 472 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TSG101Q99816 390 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 FUT8Q9BYC5 575 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 CPVLQ9H3G5 476 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMEM260Q9NX78 707 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 NYAP2Q9P242 653 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 ANO9A1A5B4 782 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 B4DLN1 442 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 LCA5LO95447 670 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 SHMT1P34896 483 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRAF1Q13077 416 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 GPS2Q13227 327 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 MCM6Q14566 821 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPA17Q15506 151 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 MIIPQ5JXC2 388 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TAF3Q5VWG9 929 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 WDR93Q6P2C0 686 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 HDXQ7Z353 690 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIAA1328Q86T90 577 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 CEP63Q96MT8 703 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 NDST4Q9H3R1 872 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 SBF2Q86WG5 1849 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYH1P12882 1939 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 G3V3G9 751 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 RIMBP2O15034 1052 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 TBX3O15119 743 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 MARCH6O60337 910 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 FCER1AP12319 257 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 HERVK_113P62684 666 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIF5AQ12840 1032 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC65Q8IXS2 484 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 CERS5Q8N5B7 392 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 HAS1Q92839 578 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC42Q96M95 316 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2CP1-201ENST00000557130 IDI2Q9BXS1 227 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms