RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC41Q15345 812 aa23.46■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 TC2NQ8N9U0 490 aa23.46■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 DDX12PQ92771 950 aa23.46■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM47Q96LD4 638 aa23.46■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.46■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.46■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 CPXCR1Q8N123 301 aa23.45■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.45■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.45■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 CYP3A7P24462 503 aa23.45■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.45■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 POTEGQ6S5H5 508 aa23.45■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.45■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 LDHDQ86WU2 507 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 PSMA7O14818 248 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 MSH4O15457 936 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 TTI2Q6NXR4 508 aa23.44■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 MMP14P50281 582 aa23.43■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 STK17AQ9UEE5 414 aa23.43■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 STIM1Q13586 685 aa23.43■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 TMX1Q9H3N1 280 aa23.43■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.42■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 H7C1D1 291 aa23.41■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 POLR2MP0CAP2 368 aa23.41■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 MTMR2Q13614 643 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 TNFAIP1Q13829 316 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 MTF1Q14872 753 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 PTPN14Q15678 1187 aa23.41■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 CHMP2AO43633 222 aa23.41■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 RGL1Q9NZL6 768 aa23.4■■□□□ 1.34
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PRDM4-205ENST00000550376 Q4G0T1 1027 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 UNC13DQ70J99 1090 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PRDM4-205ENST00000550376 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.4■■□□□ 1.34
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