RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522926.1

TNIP1-216, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNIP1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-216ENST00000522926 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.52■■□□□ 1.04
TNIP1-216ENST00000522926 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.52■■□□□ 1.04
TNIP1-216ENST00000522926 RBL2Q08999 1139 aa21.51■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 MBTPS1Q14703 1052 aa21.51■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.51■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.51■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.51■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.51■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 GH1P01241 217 aa21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 ERVK-21P61565 698 aa21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 HIC1Q14526 733 aa21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 RAD9AQ99638 391 aa21.5■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 RGS22Q8NE09 1264 aa21.49■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.49■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.49■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF286BP0CG31 522 aa21.48■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 ALG1Q9BT22 464 aa21.48■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 PNMA2Q9UL42 364 aa21.48■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 KCNA5P22460 613 aa21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 PSEN2P49810 448 aa21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 EVI5LQ96CN4 794 aa21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 TTC14Q96N46 770 aa21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 NEDD4P46934 1319 aa21.47■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 B4DLN1 442 aa21.46■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 IL9P15248 144 aa21.46■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 DGKDQ16760 1214 aa21.46■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.46■■□□□ 1.03
TNIP1-216ENST00000522926 HAS3O00219 553 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 F2P00734 622 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 MFSD10Q14728 455 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 GJD3Q8N144 294 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 C7orf31Q8N865 590 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 RMDN3Q96TC7 470 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 SIP14410 1827 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 SORBS3O60504 671 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 PTK7Q13308 1070 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 IKBKEQ14164 716 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 STXBP2Q15833 593 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 ZMYM6O95789 1325 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 RGS20O76081 388 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 PDE1AP54750 535 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 IWS1Q96ST2 819 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 ABCB11O95342 1321 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 OPLAHO14841 1288 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 LGR5O75473 907 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 PNMA1Q8ND90 353 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 PPTC7Q8NI37 304 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 NR3C2P08235 984 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 PXMP2Q9NR77 195 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 MYO7AQ13402 2215 aa21.4■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 GRXCR2A6NFK2 248 aa21.4■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 EFCAB14O75071 495 aa21.4■■□□□ 1.02
TNIP1-216ENST00000522926 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms