RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ANO9A1A5B4 782 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 USP17L10C9JJH3 530 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TRAF5O00463 557 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PTGDRQ13258 359 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MTA1Q13330 715 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 BRD3Q15059 726 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 STILQ15468 1287 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 STAT1P42224 750 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PRELPP51888 382 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MORC3Q14149 939 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 LUZP1Q86V48 1076 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SCLT1Q96NL6 688 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 VCPKMTQ9H867 229 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 IVLP07476 585 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 HOXD10P28358 340 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZBED6P86452 979 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CCDC14Q49A88 953 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CXCL11O14625 94 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 JAK2O60674 1132 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PHACTR2O75167 634 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TAP1Q03518 808 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 IRF5Q13568 498 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 FIGNQ5HY92 759 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SDR42E1Q8WUS8 393 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ACAD9Q9H845 621 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PANK4Q9NVE7 773 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 IFNKQ9P0W0 207 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TMEM232C9JQI7 657 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SPC24Q8NBT2 197 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TRPC6Q9Y210 931 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ABCA3Q99758 1704 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PQJ5 194 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 BTBD18B2RXH4 712 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KCNJ18B7U540 433 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 BACH1O14867 736 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MAGEB2O15479 319 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MED7O43513 233 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 EYA4O95677 639 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MYBL1P10243 752 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 AFMP43652 599 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KCNJ12Q14500 433 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GPBP1Q86WP2 473 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CD302Q8IX05 232 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 DEPTORQ8TB45 409 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 INTUQ9ULD6 942 aa6.43□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RGPD5Q99666 1765 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms