RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 AMPD2Q01433 879 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 ATRIPQ8WXE1 791 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 FKBP15Q5T1M5 1219 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 MTMR8Q96EF0 704 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 PSME4Q14997 1843 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 B4DLN1 442 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 TXKP42681 527 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 LRRC63Q05C16 580 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 PNMA5Q96PV4 448 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 EHD4Q9H223 541 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 G3V3G9 751 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 RAD17O75943 681 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 AKR1B1P15121 316 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 MIIPQ5JXC2 388 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 NIM1KQ8IY84 436 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0895Q8NCT3 520 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 CCDC17Q96LX7 622 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 MYO6Q9UM54 1294 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 CXCL9Q07325 125 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 DACT2Q5SW24 774 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 KRT79Q5XKE5 535 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 RAD54LQ92698 747 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 JMJD4Q9H9V9 463 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 TMEM260Q9NX78 707 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 CTAGE15A4D2H0 777 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 FZD9O00144 591 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 KRT86O43790 486 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 EDIL3O43854 480 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 CTAGE8P0CG41 777 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 EHHADHQ08426 723 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 CTAGE6Q86UF2 777 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 CTAGE4Q8IX94 777 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 MRIQ9BWK5 157 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 RASSF10A6NK89 507 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 GRIN3BO60391 1043 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 ERLIN1O75477 346 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 HYIQ5T013 277 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 CUL5Q93034 780 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 FUT8Q9BYC5 575 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 EDEM3Q9BZQ6 932 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 GBP3Q9H0R5 595 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 MYMKA6NI61 221 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 HLA-DOAP06340 250 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 FCER1AP12319 257 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 JDP2Q8WYK2 163 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 COA7Q96BR5 231 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 HERVK_113P62684 666 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 ADGRF4Q8IZF3 695 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 RNF181Q9P0P0 153 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 MAP2K7O14733 419 aa26.45■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB5O15062 677 aa26.45■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 SLC37A4O43826 429 aa26.45■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 SHMT1P34896 483 aa26.45■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.45■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 MCTP2Q6DN12 878 aa26.45■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 TSGA10Q9BZW7 698 aa26.45■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 USP40Q9NVE5 1235 aa26.45■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 ANO9A1A5B4 782 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 MAN2A1Q16706 1144 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 LONRF2Q1L5Z9 754 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 VWA3BQ502W6 1294 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 EPC1Q9H2F5 836 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 TDP2O95551 362 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 ABL1P00519 1130 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 PICALMQ13492 652 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 MCM6Q14566 821 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
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