RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391173.1

RNU6-400P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 400, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-400P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-400P-201ENST00000391173 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-400P-201ENST00000391173 EPM2AB3EWF7 344 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 LATO43561 262 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 B3GALT2O43825 422 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 IGKV3-11P04433 115 aa-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-400P-201ENST00000391173 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-400P-201ENST00000391173 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-400P-201ENST00000391173 CRISP1P54107 249 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-400P-201ENST00000391173 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-400P-201ENST00000391173 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-400P-201ENST00000391173 ZNF441Q8N8Z8 693 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 AMER3Q8N944 861 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 RHBDD1Q8TEB9 315 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 FRS2Q8WU20 508 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 NSMCE1Q8WV22 266 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 LPPQ93052 612 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 TRIM63Q969Q1 353 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 PLD4Q96BZ4 506 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 HMCESQ96FZ2 354 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZNF479Q96JC4 524 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-400P-201ENST00000391173 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-400P-201ENST00000391173 NEUROD1Q13562 356 aa-0.84□□□□□ -2.54
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RNU6-400P-201ENST00000391173 PRR31Q5SQ13 230 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 LDLRAD1Q5T700 205 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 MORN5Q5VZ52 161 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 NUTM2GQ5VZR2 741 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-400P-201ENST00000391173 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
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