RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295317.3

RNF149-201, Transcript of ring finger protein 149, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF149, Length 2,458 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF149-201ENST00000295317 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.09■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.09■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 THAP9Q9H5L6 903 aa24.09■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.09■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 POLD4Q9HCU8 107 aa24.09■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 TBC1D5Q92609 795 aa24.08■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 CARD6Q9BX69 1037 aa24.08■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 RAB34Q9BZG1 259 aa24.08■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.08■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 OPLAHO14841 1288 aa24.08■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 BMP3P12645 472 aa24.08■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.08■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 TTLL6Q8N841 843 aa24.08■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RNF149-201ENST00000295317 TPM1P09493 284 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 FBXO11Q86XK2 927 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 RASSF10A6NK89 507 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 MEIS1O00470 390 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 CASQ1P31415 396 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 ARHGAP4P98171 946 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 AMNQ9BXJ7 453 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 STK17AQ9UEE5 414 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 FAM86B1E9PN63 330 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 SYCP1Q15431 976 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 UNC13DQ70J99 1090 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 KIFC2Q96AC6 838 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 POTEFA5A3E0 1075 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 ENTPD3O75355 529 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 POTEIP0CG38 1075 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 CBX1P83916 185 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 DLGAP5Q15398 846 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 MIIPQ5JXC2 388 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 POTEGQ6S5H5 508 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 MED24O75448 989 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 KCNA3P22001 575 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 UBXN2AP68543 259 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 CCDC174Q6PII3 467 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.05■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 PSMC6P62333 389 aa24.04■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.04■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.04■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 GMCL1Q96IK5 515 aa24.04■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.04■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.04■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 BICDL2A1A5D9 508 aa24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 CENPPQ6IPU0 288 aa24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 WDR59Q6PJI9 974 aa24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.03■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 CNTNAP1P78357 1384 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 CYP4A11Q02928 519 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 COASYQ13057 564 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 OGFOD1Q8N543 542 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 GMLQ99445 158 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 EPHB6O15197 1021 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 CYP26C1Q6V0L0 522 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 LENG9Q96B70 501 aa24.02■■□□□ 1.44
RNF149-201ENST00000295317 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.01■■□□□ 1.43
RNF149-201ENST00000295317 CFBP00751 764 aa24.01■■□□□ 1.43
RNF149-201ENST00000295317 PLA2G4BP0C869 781 aa24.01■■□□□ 1.43
RNF149-201ENST00000295317 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.01■■□□□ 1.43
RNF149-201ENST00000295317 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.01■■□□□ 1.43
RNF149-201ENST00000295317 PANK4Q9NVE7 773 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms