RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 RAB21Q9UL25 225 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 GTF2IP78347 998 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 DDX12PQ92771 950 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 COA1Q9GZY4 146 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CD209Q9NNX6 404 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 LRP6O75581 1613 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ERVK-24P63145 666 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TMEM139Q8IV31 216 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ANXA13P27216 316 aa9.74□□□□□ -0.85
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HERC3-201ENST00000264345 FUT8Q9BYC5 575 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PBX1P40424 430 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 RASSF7Q02833 373 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 MOCS3O95396 460 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 FERP16591 822 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 RASA1P20936 1047 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TNFAIP3P21580 790 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PDXDC1Q6P996 788 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 WHAMMQ8TF30 809 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 USP17L5A8MUK1 530 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 C2orf54Q08AI8 447 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 FUT2Q10981 343 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF25Q93038 417 aa9.73□□□□□ -0.85
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HERC3-201ENST00000264345 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.73□□□□□ -0.85
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HERC3-201ENST00000264345 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PLA2G4BP0C869 781 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP25P42331 645 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 NNTQ13423 1086 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 AMNQ9BXJ7 453 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 KANSL2Q9H9L4 492 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PP2D1A8MPX8 630 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PRLRP16471 622 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 STAT1P42224 750 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 VSNL1P62760 191 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 COA7Q96BR5 231 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CHP1Q99653 195 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 STIM2Q9P246 746 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SERPINB2P05120 415 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-201ENST00000264345 FBXO11Q86XK2 927 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 32.1
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HERC3-201ENST00000264345 RAB17Q9H0T7 212 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 EPC1Q9H2F5 836 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 GOPCQ9HD26 462 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CEP104O60308 925 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 GBP1P32455 592 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PDE6BP35913 854 aa9.72□□□□□ -0.85
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