RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D5Q92609 795 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 PGBD1Q96JS3 809 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf42Q96LP6 360 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SH2D4AQ9H788 454 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 GINM1Q9NU53 330 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 C19orf81C9J6K1 198 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 STXBP3O00186 592 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCL11O14625 94 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SCG2P13521 617 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SYT1P21579 422 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 DDIT3P35638 169 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 NT5C2P49902 561 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 GNAQP50148 359 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 STAT2P52630 851 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RCAN1P53805 252 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP14P54578 494 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 FSTL1Q12841 308 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SNAPC2Q13487 334 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PLS1Q14651 629 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2SQ16763 222 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT40Q6A162 431 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 C8orf76Q96K31 380 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K14Q99558 947 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM260Q9NX78 707 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 BTBD7Q9P203 1132 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MTMR6Q9Y217 621 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RIPK3Q9Y572 518 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF536O15090 1300 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 STK36Q9NRP7 1315 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L15C9J2P7 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L11C9JVI0 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L18D6R9N7 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L22D6RA61 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L19D6RCP7 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L20D6RJB6 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PDHXO00330 501 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB5O15062 677 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CNMDO75829 334 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CDKL5O76039 1030 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 DEXIO95424 95 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CETPP11597 493 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2A2P52657 109 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 NAPAP54920 295 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L24Q0WX57 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 NR5A1Q13285 461 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 NPY5RQ15761 445 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MCTP1Q6DN14 999 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 REPS2Q8NFH8 660 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 LPAR1Q92633 364 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MTMR8Q96EF0 704 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CAPNS2Q96L46 248 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 FEM1BQ9UK73 627 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 BTBD18B2RXH4 712 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 VWA5AO00534 786 aa6.94□□□□□ -1.3
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