RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472758.5

ZNF638-215, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 3

Gene ZNF638, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-215	ENST00000472758	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	ALG3	Q92685	438 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758		H0Y8X5	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	GLI4	P10075	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	IMPDH2	P12268	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	CORO7	P57737	925 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	NTM	Q9P121	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF638-215	ENST00000472758	RAB33A	Q14088	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758		C9IYK1	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	ACVRL1	P37023	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	GDF5	P43026	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CDSN	Q15517	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	MKL1	Q969V6	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CYR61	O00622	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CASP7	P55210	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	RASA3	Q14644	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758		A0A1W2PQH9	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	ACR	P10323	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	IFNGR1	P15260	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	L1CAM	P32004	1257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	ZNF445	P59923	1031 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	DDR2	Q16832	855 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-215	ENST00000472758	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms