RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 ZEB2O60315 1214 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 CLTBP09497 229 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 CALM1P0DP23 149 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 CALM2P0DP24 149 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 CALM3P0DP25 149 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 GNAQP50148 359 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 GHRHRQ02643 423 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT32Q14532 448 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP2R5BQ15173 497 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 IWS1Q96ST2 819 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 TOX2Q96NM4 488 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 PXMP2Q9NR77 195 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 SMARCA1P28370 1054 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 STXBP2Q15833 593 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 MICU3Q86XE3 530 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 ARVCFO00192 962 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 CABYRO75952 493 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 POLR2MP0CAP2 368 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 CDK7P50613 346 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 FAAP100Q0VG06 881 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 TTLL4Q14679 1199 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 TDHQ8IZJ6 230 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 FANCBQ8NB91 859 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 COPS5Q92905 334 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 BADQ92934 168 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 REC8O95072 547 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 ARIH2O95376 493 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 NR3C2P08235 984 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 HSPA4P34932 840 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNB2Q92953 911 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA0355O15063 1070 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 CPT1AP50416 773 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 APOA5Q6Q788 366 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 MYL3P08590 195 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 CPA1P15085 419 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 RAG1P15918 1043 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGB8P26012 769 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMC6P62333 389 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGA7Q13683 1181 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 GRIN2DO15399 1336 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 PGM5Q15124 567 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 IL31RAQ8NI17 732 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 TBX21Q9UL17 535 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB43O43298 467 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 FGD1P98174 961 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 PURAQ00577 322 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 LY6KQ17RY6 165 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.35■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 GH1P01241 217 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms