RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 CMA1P23946 247 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 KSR2Q6VAB6 950 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ANO5Q75V66 913 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PYGMP11217 842 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 IFNAR2P48551 515 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNJ6P48051 423 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MYH11P35749 1972 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 NFKBIAP25963 317 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CORO7P57737 925 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 LINS1Q8NG48 757 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ST7Q9NRC1 585 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TNNI2P48788 182 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 AP1B1Q10567 949 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 NME9Q86XW9 330 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 STAM2O75886 525 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ADCY8P40145 1251 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ALCAMQ13740 583 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 SYCP2LQ5T4T6 812 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ENO4A6NNW6 628 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC159P0C7I6 412 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 VSTM4Q8IW00 320 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GSTA2P09210 222 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DEFA1P59665 94 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DEFA3P59666 94 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CENPUQ71F23 418 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCC12Q96J65 1359 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DTNBO60941 627 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ATICP31939 592 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 LONP1P36776 959 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PDCLQ13371 301 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CASP14P31944 242 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA1Q5VX52 437 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TADA3O75528 432 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 FLOT2Q14254 428 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ADRM1Q16186 407 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 STX19Q8N4C7 294 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 FMO2Q99518 471 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CNPY3Q9BT09 278 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DNM3Q9UQ16 869 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF10O15013 1369 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GSTA1P08263 222 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP10DQ9P241 1426 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPRKQ15262 1439 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MCF2LO15068 1137 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 NEK9Q8TD19 979 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 54.9
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM51Q9NW97 253 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 FLT4P35916 1363 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CHEK2O96017 543 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CUL4AQ13619 759 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GMNCA6NCL1 334 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF233A6NK53 670 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 BUB1O43683 1085 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 NCAPH2Q6IBW4 605 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 HORMAD1Q86X24 394 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP3K5Q99683 1374 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM247A6NEH6 219 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms