RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338523.8

SNX10-201, Transcript of sorting nexin 10, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX10, Length 2,546 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10-201ENST00000338523 CALML4Q96GE6 196 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX10-201ENST00000338523 TEPSINQ96N21 525 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX10-201ENST00000338523 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 FAM86B1E9PN63 330 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 CBFA2T2O43439 604 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 UQCRHP07919 91 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 PTGER2P43116 358 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ASIC1P78348 528 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ARHGAP4P98171 946 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 PAK1Q13153 545 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 TNIP1Q15025 636 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 MYMKA6NI61 221 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 GSDMDP57764 484 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 PDE4DQ08499 809 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ADSSL1Q8N142 457 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 VPS16Q9H269 839 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 GOPCQ9HD26 462 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 HACL1Q9UJ83 578 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 TBC1D12O60347 775 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 INPP5BP32019 993 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 CEP135Q66GS9 1140 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 VCPKMTQ9H867 229 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 RHOBTB3O94955 611 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 PDIA5Q14554 519 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 KRT79Q5XKE5 535 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 CCDC125Q86Z20 511 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 RMND1Q9NWS8 449 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.82□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 A0A1B0GTH6 734 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 E9PMD0 336 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 DLK2Q6UY11 383 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 SV2BQ7L1I2 683 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 PSME4Q14997 1843 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 KRT31Q15323 416 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 IDEP14735 1019 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 USP11P51784 963 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 LENG9Q96B70 501 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 FEZ1Q99689 392 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 POLD4Q9HCU8 107 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 POTEB3A0JP26 581 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 POTECB2RU33 542 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ASNSP08243 561 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 MAP3K10Q02779 954 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 KCNB1Q14721 858 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 POTEBQ6S5H4 581 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ZNF592Q92610 1267 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 DDX12PQ92771 950 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 FZD9O00144 591 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 MEIS1O00470 390 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 TNNT1P13805 278 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ERCC3P19447 782 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 RAD54LQ92698 747 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 RAB34Q9BZG1 259 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 CUEDC2Q9H467 287 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 EXOC1Q9NV70 894 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 MED24O75448 989 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 TPM2P07951 284 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX10-201ENST00000338523 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms