RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 OGFRQ9NZT2 677 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 ASNSP08243 561 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 SLC12A2P55011 1212 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 MYL7Q01449 175 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 NR5A1Q13285 461 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 DESI2Q9BSY9 194 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 STK17AQ9UEE5 414 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 IGKV5-2P06315 115 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 COL15A1P39059 1388 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 CHD1O14646 1710 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 TBC1D8O95759 1140 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 ELF2Q15723 593 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 BIRC2Q13490 618 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 PPP2R5EQ16537 467 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 DGKHQ86XP1 1220 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 ACCSQ96QU6 501 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 RNF8O76064 485 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 MFAP3P55082 362 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 HAUS1Q96CS2 278 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 TET3O43151 1660 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 KIF11P52732 1056 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 BUB1O43683 1085 aa22.14■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 DISC1Q9NRI5 854 aa22.14■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.14■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.14■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 ZMYND15Q9H091 742 aa22.14■■□□□ 1.14
USP25-202ENST00000285681 KRIT1O00522 736 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 A6NNZ2 444 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 CRKP46108 304 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 PODNQ7Z5L7 613 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 PPP2R5CQ13362 524 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 OATP04181 439 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 P2RX5Q93086 422 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 GH2P01242 217 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 SLFN14P0C7P3 912 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 Q3C1V9 767 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 DENND2CQ68D51 928 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 NDUFAB1O14561 156 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 UBE2SQ16763 222 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 TMEM206Q9H813 350 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 MYL1P05976 194 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 LRRC41Q15345 812 aa22.12■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 P3H4Q92791 437 aa22.12■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 ATP2A3Q93084 1043 aa22.12■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 CD209Q9NNX6 404 aa22.12■■□□□ 1.13
USP25-202ENST00000285681 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms