RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARID3AQ99856 593 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLGA2Q08379 1002 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DPYSL4O14531 572 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM117AQ9C073 453 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARID3CA6NKF2 412 aa8.91□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDIA6Q15084 440 aa8.91□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.91□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR37O15354 613 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHF12Q96QT6 1004 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.89□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HRCP23327 699 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC102AQ96A19 550 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUTM2FA1L443 756 aa8.87□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APBB1O00213 710 aa8.87□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DSG2Q14126 1118 aa8.87□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRPC6Q9Y210 931 aa8.86□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP2K5Q13163 448 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FLIIQ13045 1269 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IRF6O14896 467 aa8.83□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AMHR2Q16671 573 aa8.82□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMC2Q8TDI7 906 aa8.81□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.8□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNPATO15228 680 aa8.79□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXK1P85037 733 aa8.79□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FECHP22830 423 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLPP6Q8IY26 295 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP3K9P80192 1104 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MICALL2Q8IY33 904 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FCHSD2O94868 740 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OSBPP22059 807 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIC1Q14526 733 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOPCQ9HD26 462 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAK2O60296 914 aa8.73□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C2orf72A6NCS6 295 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A6NJR5 290 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MS4A1P11836 297 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIE1P35590 1138 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX12PQ92771 950 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.71□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.7□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIF3CO14782 793 aa8.67□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCM6Q14566 821 aa8.67□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTGER2P43116 358 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTGDRQ13258 359 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NECTIN2Q92692 538 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RNU6-1004P-201ENST00000516584 G3V3G9 751 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D12O60347 775 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OXER1Q8TDS5 423 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EVI5O60447 810 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POM121Q96HA1 1249 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLCN1P35523 988 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAD21O60216 631 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.59□□□□□ -1.03
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