RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 POTEBQ6S5H4 581 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 STK24Q9Y6E0 443 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 STK25O00506 426 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 NLRP6P59044 892 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-211ENST00000504624 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-211ENST00000504624 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-211ENST00000504624 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-211ENST00000504624 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 ARSIQ5FYB1 569 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 MFRPQ9BY79 579 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 PTGER2P43116 358 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 GPR153Q6NV75 609 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 PPP1R37O75864 691 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 TMC2Q8TDI7 906 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-211ENST00000504624 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-211ENST00000504624 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-211ENST00000504624 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-211ENST00000504624 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-211ENST00000504624 C2orf72A6NCS6 295 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-211ENST00000504624 NUDT7P0C024 238 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-211ENST00000504624 PBX2P40425 430 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-211ENST00000504624 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-211ENST00000504624 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-211ENST00000504624 LHX6Q9UPM6 363 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-211ENST00000504624 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-211ENST00000504624 KIF3CO14782 793 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-211ENST00000504624 SLC34A2O95436 690 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-211ENST00000504624 STAC3Q96MF2 364 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-211ENST00000504624 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-211ENST00000504624 KCNH8Q96L42 1107 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-211ENST00000504624 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-211ENST00000504624 ARHGAP33O14559 1287 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-211ENST00000504624 TBC1D12O60347 775 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-211ENST00000504624 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-211ENST00000504624 HCSTQ9UBK5 93 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-211ENST00000504624 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-211ENST00000504624 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-211ENST00000504624 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-211ENST00000504624 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-211ENST00000504624 PLPP6Q8IY26 295 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-211ENST00000504624 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 TK2O00142 265 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 FOXK1P85037 733 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 DSG2Q14126 1118 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 KCNK17Q96T54 332 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 PSEN2P49810 448 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 CFAP44Q96MT7 982 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-211ENST00000504624 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 HRO43593 1189 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 PDE4AP27815 886 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 PTPN5P54829 565 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 PTPREP23469 700 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 OXER1Q8TDS5 423 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-211ENST00000504624 WNT2BQ93097 391 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 NBPF3Q9H094 633 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 FOSBP53539 338 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 MAP3K9P80192 1104 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 JPH4Q96JJ6 628 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 EVI5O60447 810 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 MFSD10Q14728 455 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-211ENST00000504624 RGS20O76081 388 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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