RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SEC24BO95487 1268 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 IER5LQ5T953 404 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SEMA3EO15041 775 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CAMK2BQ13554 666 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-207ENST00000470201 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-207ENST00000470201 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-207ENST00000470201 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-207ENST00000470201 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-207ENST00000470201 PLCG2P16885 1265 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-207ENST00000470201 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-207ENST00000470201 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-207ENST00000470201 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.881e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-207ENST00000470201 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-207ENST00000470201 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-207ENST00000470201 OCEL1Q9H607 264 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ZMYND10O75800 440 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-207ENST00000470201 MICALL2Q8IY33 904 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-207ENST00000470201 NEUROD2Q15784 382 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-207ENST00000470201 BARGINQ6ZT62 677 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 DSG2Q14126 1118 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 PDIA6Q15084 440 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 TMC2Q8TDI7 906 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 POTEMA6NI47 508 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 DPYSL4O14531 572 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXK1P85037 733 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 POTEGQ6S5H5 508 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-207ENST00000470201 G3V3G9 751 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-207ENST00000470201 AK7Q96M32 723 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF3CO14782 793 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-207ENST00000470201 PLPP6Q8IY26 295 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-207ENST00000470201 C2orf72A6NCS6 295 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-207ENST00000470201 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-207ENST00000470201 C14orf37Q86TY3 774 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-207ENST00000470201 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-207ENST00000470201 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP3K9P80192 1104 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR37O15354 613 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 ST18O60284 1047 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM66O15016 1216 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 SNPHO15079 494 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 OXER1Q8TDS5 423 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 PDE4DQ08499 809 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 PTGER2P43116 358 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP2K5Q13163 448 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 NUTM2FA1L443 756 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 OSBPP22059 807 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D12O60347 775 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 GNPATO15228 680 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 HIC1Q14526 733 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC102AQ96A19 550 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 FCHSD2O94868 740 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 IL27Q8NEV9 243 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX12PQ92771 950 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 EVI5O60447 810 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 IRF6O14896 467 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 AMHR2Q16671 573 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 MARVELD3Q96A59 401 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 ARXQ96QS3 562 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC34A2O95436 690 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-207ENST00000470201 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-207ENST00000470201 PTGDRQ13258 359 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-207ENST00000470201 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms