RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF174Q15697 407 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 SMC1BQ8NDV3 1235 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 FERMT2Q96AC1 680 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX13BQ9BXU2 312 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF3CO14782 793 aa35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 OSBPP22059 807 aa35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPREP23469 700 aa35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 USP11P51784 963 aa35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ALAS1P13196 640 aa35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 EHMT1Q9H9B1 1298 aa35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 WNT7AO00755 349 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CFBP00751 764 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MCM7P33993 719 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD17B4P51659 736 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 HUNKP57058 714 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGDRQ13258 359 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 LETM2Q2VYF4 491 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SPRYD7Q5W111 196 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP4R3AQ6IN85 833 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC4DQ8WXI8 215 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 PNMA3Q9UL41 463 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM132BQ14DG7 1078 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 GPAT2Q6NUI2 795 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MOXD1Q6UVY6 613 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MS4A4AQ96JQ5 239 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CMA1P23946 247 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TRERF1Q96PN7 1200 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SREBF1P36956 1147 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPHP41219 470 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYGNQ8WXF5 182 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 STAT3P40763 770 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 HERVK_113P62684 666 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa35.26■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 C4orf32Q8N8J7 132 aa35.26■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF146Q9NTX7 359 aa35.26■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 NEMFO60524 1076 aa35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 NFIBO00712 420 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP4P98171 946 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL15Q16663 113 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD23Q86SG2 305 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SAPCD2Q86UD0 394 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CHST13Q8NET6 341 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TOMM70O94826 608 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP3A4P08684 503 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP3A7P24462 503 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 COPB2P35606 906 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MUM1L1Q5H9M0 696 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FSIP1Q8NA03 581 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D5Q92609 795 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM160A1Q05DH4 1040 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RESP18Q5W5W9 173 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RIOX2Q8IUF8 465 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ACAD9Q9H845 621 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO40Q9UH90 709 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 EDIL3O43854 480 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FCHSD1Q86WN1 690 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MBOAT7Q96N66 472 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 HOMER2Q9NSB8 354 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RIPK3Q9Y572 518 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52Z1P0C646 297 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 LIG1P18858 919 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CIITAP33076 1130 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PLS1Q14651 629 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TPRNQ4KMQ1 711 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RGMBQ6NW40 437 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TLL2Q9Y6L7 1015 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SHC4Q6S5L8 630 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 DTHD1Q6ZMT9 781 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF207Q6ZRF8 634 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 BRI3BPQ8WY22 251 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CLIC6Q96NY7 704 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATC1LQ9H0A9 340 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM63CQ9P1W3 806 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
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