RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MCM4P33991 863 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 COPB2P35606 906 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HERVK_113P62684 666 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CHST13Q8NET6 341 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PCNTO95613 3336 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BTBD19C9JJ37 291 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MEIS2O14770 477 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRPA1O75762 1119 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 YEATS4O95619 227 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC25A27O95847 323 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CFBP00751 764 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GHRHRQ02643 423 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SREBF2Q12772 1141 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PLS1Q14651 629 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ANO1Q5XXA6 986 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPATA32Q96LK8 384 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FBXO40Q9UH90 709 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CNPY2Q9Y2B0 182 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ELP1O95163 1332 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC85CA6NKD9 419 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OPLAHO14841 1288 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TM4SF4P48230 202 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HSD17B4P51659 736 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 USP11P51784 963 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCNA1P78396 465 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC39A14Q15043 492 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STK38Q15208 465 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NFKBIBQ15653 356 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TTC38Q5R3I4 469 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NEK8Q86SG6 692 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TBCKQ8TEA7 893 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 USP28Q96RU2 1077 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACAD9Q9H845 621 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RNF146Q9NTX7 359 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM260Q9NX78 707 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RNF186Q9NXI6 227 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BTBD7Q9P203 1132 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LAD1O00515 517 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ADAMTS3O15072 1205 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPTLC2O15270 562 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FIBPO43427 364 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PPP6R2O75170 966 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATP2B1P20020 1258 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UBE2SQ16763 222 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 INF2Q27J81 1249 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PTPN18Q99952 460 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ANO3Q9BYT9 981 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms