RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479433.5

FBXO18-211, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 3

Gene FBXO18, Length 527 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-211ENST00000479433 DGKHQ86XP1 1220 aa7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 RILPL2Q969X0 211 aa7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 TRPV6Q9H1D0 765 aa7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 VTA1Q9NP79 307 aa7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 MTMR7Q9Y216 660 aa7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 TRIOO75962 3097 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 ASB14A6NK59 587 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 CYTH3O43739 400 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 CYP21A2P08686 494 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 CHMLP26374 656 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 CYP2C18P33260 490 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 PBX2P40425 430 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 PSMC6P62333 389 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 CCDC96Q2M329 555 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 IQSEC1Q6DN90 963 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 MFSD5Q6N075 450 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 NSMFQ6X4W1 530 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 USP38Q8NB14 1042 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 PNMA1Q8ND90 353 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 RGS22Q8NE09 1264 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 COPS5Q92905 334 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 Q9Y3F1 56 aa7.54□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 TNKSO95271 1327 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 A6NJR5 290 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 B4GALT4O60513 344 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 CSF2RAP15509 400 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 ARHGAP1Q07960 439 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 TET1Q8NFU7 2136 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 IL31RAQ8NI17 732 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 KAT2BQ92831 832 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 FAM161BQ96MY7 647 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 MAD2L2Q9UI95 211 aa7.53□□□□□ -1.2
FBXO18-211ENST00000479433 C5orf42Q9H799 3197 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 ZNF213O14771 459 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 SGSM2O43147 1006 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 ARHGEF15O94989 841 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 RAG1P15918 1043 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 NT5C2P49902 561 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 HSD17B4P51659 736 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 FPGSQ05932 587 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 TROAPQ12815 778 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 ITGA7Q13683 1181 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 ADGRE1Q14246 886 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 HIC1Q14526 733 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 GRIN2CQ14957 1233 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 TCTN1Q2MV58 587 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 ESR2Q92731 530 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 TOMM22Q9NS69 142 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
FBXO18-211ENST00000479433 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms