RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468516.1

FOXN4-204, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

TSL 2

Gene FOXN4, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-204ENST00000468516 ARHGAP6O43182 974 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 SLC37A4O43826 429 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 PRCPP42785 496 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 AMPD3Q01432 767 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 PTPN14Q15678 1187 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 TC2NQ8N9U0 490 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 FAM151AQ8WW52 585 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 NELFBQ8WX92 580 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 TRIM9Q9C026 710 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 CNTNAP1P78357 1384 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 F5H6K3 240 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 STX10O60499 249 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 TDP2O95551 362 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 SLURP2P0DP57 97 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 CYP3A7P24462 503 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 SLC16A2P36021 539 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 USP11P51784 963 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 STX17P56962 302 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 ATP2B2Q01814 1243 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 KLRC3Q07444 240 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 GRB10Q13322 594 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 STIM1Q13586 685 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 HYIQ5T013 277 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 CEP135Q66GS9 1140 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-204ENST00000468516 PSMD14O00487 310 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 TBC1D12O60347 775 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 NDUFB10O96000 172 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 FECHP22830 423 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 TECP42680 631 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 TNNI2P48788 182 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 UBE2SQ16763 222 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 PANX2Q96RD6 677 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 CSRNP1Q96S65 589 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 THAP9Q9H5L6 903 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 GDAQ9Y2T3 454 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 PSMA7O14818 248 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 KRT31Q15323 416 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 SYCP1Q15431 976 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 FAM83AQ86UY5 434 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 PNMA5Q96PV4 448 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 AMNQ9BXJ7 453 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 GDF11O95390 407 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 GH2P01242 217 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 BMP3P12645 472 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 DPEP1P16444 411 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 TXKP42681 527 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 JAG1P78504 1218 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 TRAF1Q13077 416 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 TRIM14Q14142 442 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 DLGAP5Q15398 846 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 TTI2Q6NXR4 508 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 HAS1Q92839 578 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 CCDC51Q96ER9 411 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 ANO3Q9BYT9 981 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 RNF39Q9H2S5 420 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 BICDL2A1A5D9 508 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 MEIS2O14770 477 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-204ENST00000468516 TBX3O15119 743 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms