RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 E9PMD0 336 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 ETF1P62495 437 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.234e-6■■■■□ 21.6
ZBED1-202ENST00000381222 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 DCCP43146 1447 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 ABCB4P21439 1286 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 ADAM9Q13443 819 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 TSPYL1Q9H0U9 437 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC93Q567U6 631 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 MIER3Q7Z3K6 550 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 PODNQ7Z5L7 613 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 ZBED4O75132 1171 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 TRAPPC10P48553 1259 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 KRT5P13647 590 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 PRCPP42785 496 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 TMTC1Q8IUR5 882 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 SP8Q8IXZ3 490 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED1-202ENST00000381222 STAT2P52630 851 aa16.46■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 KLHL30Q0D2K2 578 aa16.46■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 NEDD1Q8NHV4 660 aa16.46■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.46■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 SWAP70Q9UH65 585 aa16.46■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 FCER1AP12319 257 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 TRIML1Q8N9V2 468 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ORC4O43929 436 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ERLIN2O94905 339 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ANO3Q9BYT9 981 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 IQCB1Q15051 598 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 KRT31Q15323 416 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 SMIM23A6NLE4 172 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 IKBKBO14920 756 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 GRM4Q14833 912 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 POTEB3A0JP26 581 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 POTECB2RU33 542 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ZMYND10O75800 440 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 MTF1Q14872 753 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 XKR9Q5GH70 373 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 POTEBQ6S5H4 581 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ERO1AQ96HE7 468 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 NT5C3AQ9H0P0 336 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 BARHL2Q9NY43 387 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 DLG5Q8TDM6 1919 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 NEFHP12036 1026 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ODR4Q5SWX8 454 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 STK36Q9NRP7 1315 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 NF2P35240 595 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 GALNT17Q6IS24 598 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 NBPF3Q9H094 633 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 GBP3Q9H0R5 595 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 EPC1Q9H2F5 836 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 KRT222Q8N1A0 295 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 EHBP1Q8NDI1 1231 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 P2RX5Q93086 422 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 POTEFA5A3E0 1075 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 POTEIP0CG38 1075 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 NR2F2P24468 414 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 POTEGQ6S5H5 508 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 NLRX1Q86UT6 975 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
ZBED1-202ENST00000381222 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms