RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 C8orf48Q96LL4 319 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 PLAAQ9Y263 795 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PP55 124 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 FZD9O00144 591 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 DDNO94850 711 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CES1P23141 567 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CASP7P55210 303 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TBX4P57082 545 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ACDQ96AP0 544 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CRBNQ96SW2 442 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 IER2Q9BTL4 223 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC3Q9BY71 257 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPRCP08575 1304 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 PRC1O43663 620 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 FXNQ16595 210 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GRM8O00222 908 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 PPIP5K2O43314 1243 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 PLA2G4AP47712 749 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 FCGRTP55899 365 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CTSWP56202 376 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GPSM2P81274 684 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 NIM1KQ8IY84 436 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 EYA3Q99504 573 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 XYLBO75191 536 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGB2P05107 769 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 IMPDH2P12268 514 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 PHKA2P46019 1235 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXO4P98177 505 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 C4orf17Q53FE4 359 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GPC2Q8N158 579 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 PMM1Q92871 262 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GREM2Q9H772 168 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 POLLQ9UGP5 575 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 USP20Q9Y2K6 914 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CRKP46108 304 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF165P49910 485 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CXCL9Q07325 125 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TNIP1Q15025 636 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 AOC3Q16853 763 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 AIDAQ96BJ3 306 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GMCL1Q96IK5 515 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 MPHOSPH8Q99549 860 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms