RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587622.1

RPS6KB1-210, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, human

TSL 5

Gene RPS6KB1, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KB1-210	ENST00000587622	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	AGRP	O00253	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	GDNF	P39905	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	BVES	Q8NE79	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	FGD4	Q96M96	766 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622		A0A1W2PQU0	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ITGAV	P06756	1048 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SV2C	Q496J9	727 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	GSN	P06396	782 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	FGFR1	P11362	822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	INSRR	P14616	1297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	BMP8B	P34820	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CTSK	P43235	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KB1-210	ENST00000587622	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622		H0Y8X5	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ZNF205	O95201	554 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SCG5	P05408	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	BRF1	Q92994	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622		H3BS24	57 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	TBX1	O43435	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	HSD3B2	P26439	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	CDC45	O75419	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	ESR1	P03372	595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KB1-210	ENST00000587622	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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