RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 CORO7P57737 925 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 DAB2P98082 770 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 FBXO27Q8NI29 283 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 CLEC3AO75596 197 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 FSHBP01225 129 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 ACVRL1P37023 503 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 GJA9P57773 515 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 PDLIM7Q9NR12 457 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 PLATP00750 562 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 GSNP06396 782 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 ASGR2P07307 311 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 PRR5P85299 388 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 PWP1Q13610 501 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 Q8N1X5 172 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 ATG4CQ96DT6 458 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 SLC12A9Q9BXP2 914 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 F6X3S4 739 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 CYR61O00622 381 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 SLPIP03973 132 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 HMGA2P52926 109 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM192Q8IY95 271 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 DRC1Q96MC2 740 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 C8orf49Q96NF6 230 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 MENTQ9BUN1 341 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 PARP2Q9UGN5 583 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 GREM1O60565 184 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 TACR2P21452 398 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 CYP2R1Q6VVX0 501 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 TMC4Q7Z404 712 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 RELL1Q8IUW5 271 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 FAN1Q9Y2M0 1017 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 TNFRSF10CO14798 259 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 SHOXO15266 292 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 RECKO95980 971 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 GLI4P10075 376 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 C6P13671 934 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 MC3RP41968 323 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 ANTXR1Q9H6X2 564 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 NTMQ9P121 344 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 ITGAEP38570 1179 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 GDF5P43026 501 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 F8W031 263 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 MEIS1O00470 390 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 CDSNQ15517 529 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 BICRALQ6AI39 1079 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 LOXL4Q96JB6 756 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 MRIQ9BWK5 157 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 A0A1W2PQ27 194 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 A0A1W2PQ64 194 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 A0A1W2PQC6 194 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 A0A1W2PQD8 194 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 PMLP29590 882 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 PSMD2Q13200 908 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-202ENST00000558300 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms