RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760		A0A087WZG4	1122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	STXBP3	O00186	592 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	HRK	O00198	91 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	N4BP3	O15049	544 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	ARL4A	P40617	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	POU4F1	Q01851	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	JAML	Q86YT9	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	WHRN	Q9P202	907 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PQ27	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PQ64	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PQC6	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PQD8	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	AURKA	O14965	403 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CASP7	P55210	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	DBH	P09172	617 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	INHBB	P09529	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	BMP7	P18075	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ABLIM1	O14639	778 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	PPM1B	O75688	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM13	O60858	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	HOXA5	P20719	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	L1CAM	P32004	1257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760		B2RBV5	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	KCNH1	O95259	989 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ETFB	P38117	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	LIMS1	P48059	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	SEPHS1	P49903	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	PRR5	P85299	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	AMPD2	Q01433	879 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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