RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476590.1

CD55-208, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), human

TSL 1 (best)

Gene CD55, Length 2,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD55-208	ENST00000476590	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ASB3	Q9Y575	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67	5e-8	■■■□□ 15.3
CD55-208	ENST00000476590	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MSH6	P52701	1360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TTI1	O43156	1089 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PFDN1	O60925	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PHACTR2	O75167	634 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CD53	P19397	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	NLRP5	P59047	1200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PDILT	Q8N807	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CNKSR1	Q969H4	720 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SNX27	Q96L92	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	KIF14	Q15058	1648 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	AKR1B10	O60218	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MGEA5	O60502	916 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	DNAJC6	O75061	913 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	STAM2	O75886	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PRKAR2B	P31323	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	KIF5B	P33176	963 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	PMS2	P54278	862 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TYRO3	Q06418	890 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	QPCT	Q16769	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SLC26A4	O43511	780 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CDC45	O75419	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	FGA	P02671	866 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	HSPA4	P34932	840 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	GNAL	P38405	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CD55-208	ENST00000476590	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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