RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258111.4

KCNMB4-201, Transcript of potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNMB4, Length 4,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4-201ENST00000258111 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 STX2P32856 288 aa22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 PTGDRQ13258 359 aa22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 ZNF131P52739 623 aa22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 TCP10Q12799 353 aa22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 IQCB1Q15051 598 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 CHUKO15111 745 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 ERCC3P19447 782 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 SEMA3EO15041 775 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 DLGAP5Q15398 846 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 NIM1KQ8IY84 436 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 KRT12Q99456 494 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 ST7Q9NRC1 585 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 USP40Q9NVE5 1235 aa22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 TRIM37O94972 964 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 H7C1W4 665 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 KCNQ4P56696 695 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 NR1D1P20393 614 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 C2orf54Q08AI8 447 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 E2F5Q15329 346 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 HHATQ5VTY9 493 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 PALLDQ8WX93 1383 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 SASH1O94885 1247 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 VPS52Q8N1B4 723 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 CNKSR1Q969H4 720 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 XDHP47989 1333 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 PEX19P40855 299 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 BLIDQ8IZY5 108 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 ZBED6P86452 979 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 PTPRMP28827 1452 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 EHHADHQ08426 723 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 ZBTB22O15209 634 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 TRAPPC10P48553 1259 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 IGKV5-2P06315 115 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 MGARPQ8TDB4 240 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 WHAMMQ8TF30 809 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 EPC1Q9H2F5 836 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 DPH5Q9H2P9 285 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 PICK1Q9NRD5 415 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4-201ENST00000258111 TMEM232C9JQI7 657 aa22.33■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.33■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 TNKSO95271 1327 aa22.33■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 SERPINB2P05120 415 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 CALCRLQ16602 461 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 RESP18Q5W5W9 173 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 MUM1Q2TAK8 710 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 DLC1Q96QB1 1528 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 SUN1O94901 812 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 RASSF7Q02833 373 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 ERFEQ4G0M1 354 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 KIFAP3Q92845 792 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 MMP1P03956 469 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 HOOK2Q96ED9 719 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4-201ENST00000258111 VCX3BQ9H321 246 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms