RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519081.1

RNU6-988P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 988, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-988P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-988P-201ENST00000519081 MVKQ03426 396 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 CLCQ05315 142 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 VWA3BQ502W6 1294 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 NUP43Q8NFH3 380 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 JMJD8Q96S16 334 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 PRR13Q9NZ81 148 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 IMPACTQ9P2X3 320 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 TNFRSF10CO14798 259 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 SHOXO15266 292 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 MSL3P1P0C860 447 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 NME1P15531 152 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 MAPKAPK2P49137 400 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLURP1P55000 103 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 RTP5Q14D33 572 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 SPATS1Q496A3 300 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 LIMS1P48059 325 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 CRTC3Q6UUV7 619 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 ERICH6Q7L0X2 663 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC6A18Q96N87 628 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-988P-201ENST00000519081 MEIS1O00470 390 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 SRGAP3O43295 1099 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 DBHP09172 617 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 ATF2P15336 505 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 KCNC1P48547 511 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 HTRA3P83110 453 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 NR1I3Q14994 352 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 ERICH6BQ5W0A0 696 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC9A7Q96T83 725 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 UBP1Q9NZI7 540 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 VTI1BQ9UEU0 232 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 ACRP10323 421 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLP2Q04941 152 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 BDH2Q9BUT1 245 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 A0A1B0GTL3 188 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 SH3D21A4FU49 640 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 C9IYK1 514 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 CYBBP04839 570 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 GSNP06396 782 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 PFKLP17858 780 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 FOXO4P98177 505 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 SEZ6Q53EL9 994 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 LIPIQ6XZB0 460 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 GK5Q6ZS86 529 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 SAPCD2Q86UD0 394 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 BORCS6Q96GS4 357 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 NLGN1Q8N2Q7 840 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 MRS2Q9HD23 443 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 H0Y8X5 98 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 GSTM1P09488 218 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 INSRRP14616 1297 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF165P49910 485 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-988P-201ENST00000519081 AEBP1Q8IUX7 1158 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms