RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 GALK1P51570 392 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 POU4F1Q01851 419 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 RTP2Q5QGT7 225 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 FAM84AQ96KN4 292 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 APBA2Q99767 749 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 NOTOA8MTQ0 251 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 PSPNO60542 156 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 FGD4Q96M96 766 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 SLC38A3Q99624 504 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 NRDCO43847 1150 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 NAT2P11245 290 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 FXNQ16595 210 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 SHISA4Q96DD7 197 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 EFEMP2O95967 443 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 GSTM1P09488 218 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 SLC14A2Q15849 920 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 PKN1Q16512 942 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 GPR160Q9UJ42 338 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1W2PQY0 241 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 KLF4O43474 513 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 RTP1P59025 263 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 GRB10Q13322 594 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 PPP2R5DQ14738 602 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 NLRX1Q86UT6 975 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 VAMP4O75379 141 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 DDAH1O94760 285 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 BVESQ8NE79 360 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 AKT3Q9Y243 479 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 AURKAO14965 403 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 FZD5Q13467 585 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 NACADO15069 1562 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 CD3EP07766 207 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 PNLIPP16233 465 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 JAG1P78504 1218 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 AMPD2Q01433 879 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 KIR3DS1Q14943 382 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 DBX1A6NMT0 343 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 GJB6O95452 261 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 TBC1D8O95759 1140 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 KRT1P04264 644 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-220ENST00000512069 C1QTNF9P0C862 333 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.8 ms