RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 PPP4R2Q9NY27 417 aa3.69□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 B4GALT3O60512 393 aa3.68□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 CTGFP29279 349 aa3.68□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 CDK8P49336 464 aa3.68□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 NRN1LQ496H8 165 aa3.68□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 Q8TCH9 128 aa3.68□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 CYP8B1Q9UNU6 501 aa3.68□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PQY0 241 aa3.67□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 FKTNO75072 461 aa3.67□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 CYBBP04839 570 aa3.67□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 DBHP09172 617 aa3.67□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 DAB2P98082 770 aa3.67□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 BBS9Q3SYG4 887 aa3.67□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 PLEKHH3Q7Z736 793 aa3.67□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 HDAC8Q9BY41 377 aa3.67□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 IMPACTQ9P2X3 320 aa3.67□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa3.66□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 SRGAP3O43295 1099 aa3.66□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 RPL13P26373 211 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 PRR5P85299 388 aa3.66□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 C9orf131Q5VYM1 1079 aa3.66□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 LINC00116Q8NCU8 138 aa3.66□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.66□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 TCTN2Q96GX1 697 aa3.66□□□□□ -1.82
SHQ1-204ENST00000468347 BMP5P22003 454 aa3.65□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 DGCR2P98153 550 aa3.65□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 MCTP2Q6DN12 878 aa3.65□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 LINC00482Q8N8I6 264 aa3.65□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 DAGLBQ8NCG7 672 aa3.65□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa3.65□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PGRP06401 933 aa3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 SYPP08247 313 aa3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 EPHB4P54760 987 aa3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 COL10A1Q03692 680 aa3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 GPR162Q16538 588 aa3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 TPTE2Q6XPS3 522 aa3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 GAL3ST3Q96A11 431 aa3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ASPNQ9BXN1 380 aa3.64□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ALG3Q92685 438 aa3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 CEP44Q9C0F1 390 aa3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 GFRA2O00451 464 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ADH4P08319 380 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PMLP29590 882 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 THBS2P35442 1172 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 C21orf58P58505 322 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 BCO2Q9BYV7 579 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 F8W031 263 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 MASP2O00187 686 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 RAMP2O60895 175 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PPP2CBP62714 309 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PPP2CAP67775 309 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 HS1BP3Q53T59 392 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 C3orf58Q8NDZ4 430 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 CPA5Q8WXQ8 436 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 KREMEN1Q96MU8 473 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 JMJD8Q96S16 334 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ADRA1BP35368 520 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 COLEC12Q5KU26 742 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PCNX4Q63HM2 1172 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 SLFN13Q68D06 897 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 EXTL1Q92935 676 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 DDX11Q96FC9 970 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PTPN18Q99952 460 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 JADE2Q9NQC1 790 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 C9orf118A6NHY6 69 aa3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PLSCR1O15162 318 aa3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 PI16Q6UXB8 463 aa3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms