RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.67■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 WNT7AO00755 349 aa23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 OPLAHO14841 1288 aa23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 CCDC96Q2M329 555 aa23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 TLDC1Q6P9B6 456 aa23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 EMC10Q5UCC4 262 aa23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 TRIM58Q8NG06 486 aa23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 ZNF263O14978 683 aa23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 TNFRSF8P28908 595 aa23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 KLK7P49862 253 aa23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 NAA25Q14CX7 972 aa23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 MTRQ99707 1265 aa23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PQC6 194 aa23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 MOCS3O95396 460 aa23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 GUCY2FP51841 1108 aa23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 TACC1O75410 805 aa23.64■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 GLI1P08151 1106 aa23.64■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 PRCPP42785 496 aa23.64■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 IFT81Q8WYA0 676 aa23.64■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.64■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.64■■□□□ 1.38
ODC1-201ENST00000234111 RTN1Q16799 776 aa23.64■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.64■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 CCDC50Q8IVM0 306 aa23.64■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.64■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 NCK2O43639 380 aa23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ATP2C2O75185 946 aa23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 DEXIO95424 95 aa23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 LIFRP42702 1097 aa23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 CCDC170Q8IYT3 715 aa23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 B4DLN1 442 aa23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 H7C1W4 665 aa23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 C11orf91Q3C1V1 193 aa23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 RNF217Q8TC41 542 aa23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 MAGEC3Q8TD91 643 aa23.63■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 KIF3CO14782 793 aa23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 BIRC2Q13490 618 aa23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 QPCTQ16769 361 aa23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 SHISA4Q96DD7 197 aa23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 TSGA10Q9BZW7 698 aa23.62■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 RASSF10A6NK89 507 aa23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 H7C1D1 291 aa23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 CALRP27797 417 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 GUCY2DQ02846 1103 aa23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ZNF174Q15697 407 aa23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 IFT20Q8IY31 132 aa23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 SH2D4AQ9H788 454 aa23.61■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 BACH1O14867 736 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 PRLRP16471 622 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 PAFAH1B1P43034 410 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 SCTRP47872 440 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 SPA17Q15506 151 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 ACCSLQ4AC99 568 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 CD302Q8IX05 232 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 EEF2KMTQ96G04 330 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 MS4A14Q96JA4 679 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 FERMT2Q96AC1 680 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 GDF3Q9NR23 364 aa23.6■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 USP54Q70EL1 1684 aa23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 SLC8A1P32418 973 aa23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.59■■□□□ 1.37
ODC1-201ENST00000234111 CCDC42Q96M95 316 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms