RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617631.1

5S_rRNA.12-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 107 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RASA4BC9J798 803 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 J3KRW8 73 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CETN3O15182 167 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 YKT6O15498 198 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RASA4O43374 803 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SULT1B1O43704 296 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TSPAN3O60637 253 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 OLFM2O95897 454 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 UQCRHP07919 91 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 EPB41P11171 864 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HSD3B1P14060 373 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TNFAIP3P21580 790 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DNAJB2P25686 324 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NOS3P29474 1203 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HOXD12P35452 270 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HSD17B2P37059 387 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ADH7P40394 386 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CAP1Q01518 475 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 UBXN1Q04323 297 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZBTB16Q05516 673 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MPP3Q13368 585 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ELF2Q15723 593 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GEN1Q17RS7 908 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TUSC1Q2TAM9 212 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MAP7D1Q3KQU3 841 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PCNX4Q63HM2 1172 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SLC4A10Q6U841 1118 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 C16orf86Q6ZW13 317 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TMC4Q7Z404 712 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 C14orf80Q86SX3 495 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 KIAA1328Q86T90 577 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TMEM110Q86TL2 294 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RNF135Q8IUD6 432 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TMEM151BQ8IW70 566 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC83Q8IWF9 413 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 KCT2Q8NC54 265 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC110Q8TBZ0 833 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRPM4Q8TD43 1214 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RABGGTAQ92696 567 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PPP2R3CQ969Q6 453 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SPATA17Q96L03 361 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TCF12Q99081 682 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 C7orf25Q9BPX7 421 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DESI2Q9BSY9 194 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PLVAPQ9BX97 442 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NT5C3AQ9H0P0 336 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HPF1Q9NWY4 346 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 VPS18Q9P253 973 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PDP2Q9P2J9 529 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MCM8Q9UJA3 840 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ROCK1Q13464 1354 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 USP31Q70CQ4 1352 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MAP3K19Q56UN5 1328 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MROH5Q6ZUA9 1318 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 A0A1B0GVC2 190 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC162PA2VCL2 907 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TTLL13PA6NNM8 815 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC169A6NNP5 214 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 H3BRB1 525 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 WASLO00401 505 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TLR3O15455 904 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SART1O43290 800 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SPOPO43791 374 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PIP5K1CO60331 668 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SORBS3O60504 671 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ABL1P00519 1130 aa3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms