RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551041.6

RPL6-209, Transcript of ribosomal protein L6, human

TSL 2

Gene RPL6, Length 1,082 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL6-209	ENST00000551041	ACER1	Q8TDN7	264 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	C12orf42	Q96LP6	360 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	GPAA1	O43292	621 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	GNAT2	P19087	354 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	USP14	P54578	494 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	NBPF11	Q86T75	865 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	CCDC17	Q96LX7	622 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	FSD1	Q9BTV5	496 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	LNPK	Q9C0E8	428 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	NR1I2	O75469	434 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	AKR1B1	P15121	316 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	NUCB1	Q02818	461 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	EVI5L	Q96CN4	794 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	THAP11	Q96EK4	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	ZNF333	Q96JL9	665 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	FEZ1	Q99689	392 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	MYPN	Q86TC9	1320 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041		A0A1W2PRG0	241 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	USP17L15	C9J2P7	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	USP17L11	C9JVI0	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	USP17L18	D6R9N7	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	USP17L22	D6RA61	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	USP17L19	D6RCP7	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	USP17L20	D6RJB6	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	HERVK_113	P62684	666 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	PRR20E	P86478	221 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	PRR20C	P86479	221 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	PRR20D	P86480	221 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	PRR20B	P86481	221 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	PRR20A	P86496	221 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	PRKCZ	Q05513	592 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	USP17L24	Q0WX57	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	RAET1E	Q8TD07	263 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	GABRQ	Q9UN88	632 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	APP	P05067	770 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	VCAM1	P19320	739 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	MORN1	Q5T089	497 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	TICAM2	Q86XR7	235 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	COA7	Q96BR5	231 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	HTT	P42858	3142 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL6-209	ENST00000551041	TNFRSF10A	O00220	468 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	PEX10	O60683	326 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	GRK4	P32298	578 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	FLT3LG	P49771	235 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	FUT2	Q10981	343 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	IRF5	Q13568	498 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041		Q3C1V9	767 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	ZNF787	Q6DD87	383 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	TMX2	Q9Y320	296 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	MGAM	O43451	1857 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	RASA1	P20936	1047 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	TDO2	P48775	406 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	ICA1	Q05084	483 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	LBX2	Q6XYB7	198 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL6-209	ENST00000551041	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	12.76	□□□□□ -0.37

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