RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF445	P59923	1031 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	DUSP4	Q13115	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	GML	Q99445	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204		H0Y8X5	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	GSN	P06396	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	GLI1	P08151	1106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ITGA4	P13612	1032 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	CHRNE	Q04844	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	NR0B2	Q15466	257 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	OXR1	Q8N573	874 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	BRF1	Q92994	677 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204		A0A087WZG4	1122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	EPHX1	P07099	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	VAV1	P15498	845 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ETFB	P38117	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	WHRN	Q9P202	907 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	RNF32	Q9H0A6	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM2-233	ENST00000545204	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	PPM1B	O75688	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	EFEMP2	O95967	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	TXK	P42681	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	NCAPH	Q15003	741 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	FGD4	Q96M96	766 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	NRDC	O43847	1150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	PSPN	O60542	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	GSTM1	P09488	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	SNX17	Q15036	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-233	ENST00000545204	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms