RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLDN10P78369 228 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LTBP1Q14766 1721 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNASQ5JWF2 1037 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PI16Q6UXB8 463 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SV2AQ7L0J3 742 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OGFOD1Q8N543 542 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM227BQ96M60 508 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BCS1LQ9Y276 419 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAST3O60307 1309 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0D9SFI3 127 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BAG3O95817 575 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APPP05067 770 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDE6AP16499 860 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNA3P22001 575 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLRK1P26718 216 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SERPINB4P48594 390 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR44Q5JSH3 913 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 JDP2Q8WYK2 163 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSME4Q14997 1843 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.65□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BACH1O14867 736 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ECE2O60344 883 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FURINP09958 794 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMTNP53814 917 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OLFM4Q6UX06 510 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NIM1KQ8IY84 436 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF358Q9NW07 568 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM205AQ6ZU69 1335 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYH1P12882 1939 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPAA1O43292 621 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSMA5P28066 241 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRT32Q14532 448 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RABEP1Q15276 862 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AOC3Q16853 763 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP4K1Q92918 833 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OSBP2Q969R2 916 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 JAG2Q9Y219 1238 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.64□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LAMA4Q16363 1823 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A6NJY4 79 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 M0R2C6 588 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MBD4O95243 580 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCF3P15923 654 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RASA1P20936 1047 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSPA4P34932 840 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MECOMQ03112 1051 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNIP1Q15025 636 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTFR1Q15390 333 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C4orf17Q53FE4 359 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSCBQ8IWL3 235 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIX5Q8N196 739 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms