RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	RAD50	Q92878	1312 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	KDM4A	O75164	1064 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SGPL1	O95470	568 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	PGK2	P07205	417 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	STAT3	P40763	770 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	FEM1B	Q9UK73	627 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF536	O15090	1300 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CYP21A2	P08686	494 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	HOXC6	P09630	235 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CYP2C19	P33261	490 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC16A2	P36021	539 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC1A4	P43007	532 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MROH8	Q9H579	483 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC25A27	O95847	323 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	PDHB	P11177	359 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	STAT2	P52630	851 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	DPP9	Q86TI2	863 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ESR2	Q92731	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MMP19	Q99542	508 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TNKS	O95271	1327 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ATP2A1	O14983	1001 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	STRN	O43815	780 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ZBED4	O75132	1171 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	FCER1A	P12319	257 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	LHX8	Q68G74	356 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC174	Q6PII3	467 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	DCAF4	Q8WV16	495 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MAML3	Q96JK9	1138 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	PLA2G6	O60733	806 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	SNHG28	P0DPA3	235 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	CYBA	P13498	195 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	SEC23A	Q15436	765 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	FGD4	Q96M96	766 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	TTC14	Q96N46	770 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555		E7EWF7	191 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PABPC1-222	ENST00000523555	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62

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