RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	GGN	Q86UU5	652 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	LDHD	Q86WU2	507 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SIGLEC6	O43699	453 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	PRAMEF1	O95521	474 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	RTP1	P59025	263 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SLC14A2	Q15849	920 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	TEPSIN	Q96N21	525 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF205	O95201	554 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SYP	P08247	313 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	GBP1	P32455	592 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CTSK	P43235	329 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	PWP1	Q13610	501 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ARSH	Q5FYA8	562 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	RELL1	Q8IUW5	271 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SP8	Q8IXZ3	490 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	GMIP	Q9P107	970 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	CELA3B	P08861	270 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	FBLN1	P23142	703 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	CCNF	P41002	786 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	LAPTM5	Q13571	262 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	SYT8	Q8NBV8	401 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	FAM161B	Q96MY7	647 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1W2PQY0	241 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	FFAR3	O14843	346 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	MPO	P05164	745 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	ADRB1	P08588	477 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	BMP8B	P34820	402 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	VMAC	Q2NL98	169 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	ATG4C	Q96DT6	458 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	PRR13	Q9NZ81	148 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	RAG1	P15918	1043 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	TNFRSF10C	O14798	259 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	FKTN	O75072	461 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	CRK	P46108	304 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	5.61	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM192	Q8IY95	271 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	PWWP2A	Q96N64	755 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	CHST7	Q9NS84	486 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	MLEC	Q14165	292 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	VWA3B	Q502W6	1294 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	RTP2	Q5QGT7	225 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	RPTN	Q6XPR3	784 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	TMC6	Q7Z403	805 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	JMJD8	Q96S16	334 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	COPRS	Q9NQ92	184 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	SHOX	O15266	292 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
TTC3-222	ENST00000491952	SORBS3	O60504	671 aa		5.59	□□□□□ -1.51

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