RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 CNMDO75829 334 aa27.42■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 OAZ1P54368 228 aa27.42■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 ZNF543Q08ER8 600 aa27.42■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 Q3C1V9 767 aa27.42■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.42■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 TRIM47Q96LD4 638 aa27.42■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 BTBD7Q9P203 1132 aa27.42■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 SNX14Q9Y5W7 946 aa27.42■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 ATP2A1O14983 1001 aa27.41■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 ANTXR2P58335 489 aa27.41■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 CHST3Q7LGC8 479 aa27.41■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 MROH8Q9H579 483 aa27.41■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 SRRDQ9UH36 339 aa27.41■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 CCDC69A6NI79 296 aa27.4■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 PLS1Q14651 629 aa27.4■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.4■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 MAP3K14Q99558 947 aa27.4■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa27.4■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa27.4■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 STRNO43815 780 aa27.39■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 STAT3P40763 770 aa27.39■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 TMEM132BQ14DG7 1078 aa27.39■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa27.39■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.39■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 RIOX2Q8IUF8 465 aa27.39■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 TEX13BQ9BXU2 312 aa27.39■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa27.39■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 PTPN22Q9Y2R2 807 aa27.39■■□□□ 1.98
GLI3-202ENST00000428534 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CALM1P0DP23 149 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CALM2P0DP24 149 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CALM3P0DP25 149 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 ANAPC15P60006 121 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 ADCK5Q3MIX3 580 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 SYDE2Q5VT97 1194 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 POTEEQ6S8J3 1075 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 PLEKHH3Q7Z736 793 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 SOCS4Q8WXH5 440 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 LY9Q9HBG7 655 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 GPCPD1Q9NPB8 672 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 PRR12Q9ULL5 1215 aa27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 FGD1P98174 961 aa27.37■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 REPS2Q8NFH8 660 aa27.37■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.37■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 RLFQ13129 1914 aa27.37■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 A0A0G2JMZ2 1700 aa27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 DDAH1O94760 285 aa27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CTGFP29279 349 aa27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CAP1Q01518 475 aa27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 GPR142Q7Z601 462 aa27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 SGMS1Q86VZ5 419 aa27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 RAET1EQ8TD07 263 aa27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 NUDT12Q9BQG2 462 aa27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 PORCNQ9H237 461 aa27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 KIF5BP33176 963 aa27.35■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 IRF5Q13568 498 aa27.35■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 TKFCQ3LXA3 575 aa27.35■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 WDR78Q5VTH9 848 aa27.35■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 NCAPG2Q86XI2 1143 aa27.35■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CHMP4CQ96CF2 233 aa27.35■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.35■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 PARP14Q460N5 1801 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 SLC15A5A6NIM6 579 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 ERCC3P19447 782 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 GNAQP50148 359 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 TROAPQ12815 778 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 NBPF11Q86T75 865 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 ZNF654Q8IZM8 581 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 ABRAQ8N0Z2 381 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 FBXL16Q8N461 479 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 SLC5A4Q9NY91 659 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 FBXO40Q9UH90 709 aa27.34■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 PEX10O60683 326 aa27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CASTP20810 708 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 PTPREP23469 700 aa27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 GRM4Q14833 912 aa27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 C8orf34Q49A92 452 aa27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CPXCR1Q8N123 301 aa27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CHST13Q8NET6 341 aa27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.33■■□□□ 1.97
GLI3-202ENST00000428534 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
GLI3-202ENST00000428534 RPS6KB1P23443 525 aa27.32■■□□□ 1.96
GLI3-202ENST00000428534 SLC16A2P36021 539 aa27.32■■□□□ 1.96
GLI3-202ENST00000428534 FLT3LGP49771 235 aa27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms