RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNHG28P0DPA3 235 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GTF2A2P52657 109 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHKBQ93100 1093 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAPNS2Q96L46 248 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPVLQ9H3G5 476 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCL15Q16663 113 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C8orf76Q96K31 380 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C12orf42Q96LP6 360 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP3K14Q99558 947 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPRFP10586 1907 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AOC2O75106 756 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RESTQ13127 1097 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRM4Q14833 912 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FERMT3Q86UX7 667 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCAF4Q8WV16 495 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LPAR1Q92633 364 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GMCL1Q96IK5 515 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CETPP11597 493 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BMP3P12645 472 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSPA6P17066 643 aa23.54■■□□□ 1.36
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF543Q08ER8 600 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF11Q86T75 865 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WASF1Q92558 559 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC16A2P36021 539 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPN18Q99952 460 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALG1Q9BT22 464 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM232C9JQI7 657 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAK2O60296 914 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF5BP33176 963 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VEGFBP49765 207 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BTBD19C9JJ37 291 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DEXIO95424 95 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.51■■□□□ 1.35
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLRF2D3W0D1 207 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GUCY1B3Q02153 619 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.5■■□□□ 1.35
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L15C9J2P7 530 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L11C9JVI0 530 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L18D6R9N7 530 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L22D6RA61 530 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L19D6RCP7 530 aa23.48■■□□□ 1.35
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FLOT1O75955 427 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L24Q0WX57 530 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOGQ13253 232 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.48■■□□□ 1.35
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