RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 ASPNQ9BXN1 380 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 ABLIM1O14639 778 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 LRRN2O75325 713 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 CILPO75339 1184 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 PNLIPP16233 465 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 CDR1P51861 262 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 SYT8Q8NBV8 401 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 MZB1Q8WU39 189 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF428Q96B54 188 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 VWCEQ96DN2 955 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 FRMD6Q96NE9 622 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 CNKSR3Q6P9H4 555 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 IGDCC3Q8IVU1 814 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 MAP6Q96JE9 813 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 ERCC3P19447 782 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 MAPK1P28482 360 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 OLFML2BQ68BL8 750 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 USHBP1Q8N6Y0 703 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 PRR36Q9H6K5 1346 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 MAPK8P45983 427 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 LIG3P49916 1009 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 SIRT2Q8IXJ6 389 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM82A0PJX8 343 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 USP2O75604 605 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 VMACQ2NL98 169 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 HHIPL1Q96JK4 782 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 HDAC8Q9BY41 377 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 PLP2Q04941 152 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 LDHDQ86WU2 507 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 DAGLBQ8NCG7 672 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 FAM13CQ8NE31 585 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 ASB16Q96NS5 453 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 INSRRP14616 1297 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 LMNB1P20700 586 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 ATP2B2Q01814 1243 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 RTP5Q14D33 572 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 PLCD4Q9BRC7 762 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 FFAR3O14843 346 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 PLCG1P19174 1290 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 PWWP2AQ96N64 755 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 BDH2Q9BUT1 245 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 FAM221AA4D161 298 aa5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 RLBP1P12271 317 aa5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 SLC14A2Q15849 920 aa5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 WAPLQ7Z5K2 1190 aa5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-202ENST00000558300 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 MPOP05164 745 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 TNFRSF1AP19438 455 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 GNA15P30679 374 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 SLURP1P55000 103 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 BBS9Q3SYG4 887 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 TCTN2Q96GX1 697 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa5.88□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 IGSF3O75054 1194 aa5.88□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 SDHBP21912 280 aa5.88□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 RTP1P59025 263 aa5.88□□□□□ -1.47
TMOD3-202ENST00000558300 LAPTM5Q13571 262 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms