RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513333.1

EPB41L4A-208, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A, human

TSL 5

Gene EPB41L4A, Length 333 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333		F8W735	103 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PLD2	O14939	933 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TBX1	O43435	398 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CBFA2T2	O43439	604 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	OPA1	O60313	960 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PDE8A	O60658	829 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ARHGEF15	O94989	841 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TIAF1	O95411	115 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CBX7	O95931	251 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CD247	P20963	164 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CYP7A1	P22680	504 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ECI1	P42126	302 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GRIA2	P42262	883 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NEK4	P51957	841 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	EVA1C	P58658	441 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NFKB2	Q00653	900 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	AMPD3	Q01432	767 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CDK5R2	Q13319	367 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MAP7	Q14244	749 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NFKBIB	Q15653	356 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SGO2	Q562F6	1265 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	USP53	Q70EK8	1073 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FERMT3	Q86UX7	667 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FIBCD1	Q8N539	461 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	JMY	Q8N9B5	988 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ATL2	Q8NHH9	583 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GP6	Q9HCN6	339 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MCM8	Q9UJA3	840 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		2.53	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BLACE	A4D250	179 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LRRN2	O75325	713 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SLITRK5	O94991	958 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FGFR1	P11362	822 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BMP3	P12645	472 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CPE	P16870	476 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CAP2	P40123	477 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	STAT3	P40763	770 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	AMPD2	Q01433	879 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TM4SF20	Q53R12	229 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ODR4	Q5SWX8	454 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PAOX	Q6QHF9	649 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RIN3	Q8TB24	985 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RNF141	Q8WVD5	230 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	JDP2	Q8WYK2	163 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NACC1	Q96RE7	527 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ASPN	Q9BXN1	380 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		2.51	□□□□□ -2.01
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		2.51	□□□□□ -2.01

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