RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 ASB11Q8WXH4 323 aa6.89□□□□□ -1.31
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PTPRK-215ENST00000498284 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.89□□□□□ -1.31
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PTPRK-215ENST00000498284 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRK-215ENST00000498284 B2RBV5 119 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRK-215ENST00000498284 CBFA2T2O43439 604 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRK-215ENST00000498284 SOGA3Q5TF21 947 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRK-215ENST00000498284 SIGLEC6O43699 453 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRK-215ENST00000498284 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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PTPRK-215ENST00000498284 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 SERINC3Q13530 473 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 CREG2Q8IUH2 290 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 TCTN2Q96GX1 697 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 APBA2Q99767 749 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 SUSD5O60279 629 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 LTKP29376 864 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 FIBCD1Q8N539 461 aa6.82□□□□□ -1.32
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