RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	LILRA2	Q8N149	483 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	TRIM13	O60858	407 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	OXR1	Q8N573	874 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	SGPP1	Q9BX95	441 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	RFXAP	O00287	272 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	TMC7	Q7Z402	723 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	CXorf38	Q8TB03	319 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	GCM1	Q9NP62	436 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	USP47	Q96K76	1375 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	FITM1	A5D6W6	292 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	CELA3A	P09093	270 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	GRK4	P32298	578 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	PDE6B	P35913	854 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	EGR3	Q06889	387 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	GGN	Q86UU5	652 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034		Q96M66	194 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	DUSP13	Q9UII6	198 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	UST	Q9Y2C2	406 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SUMO1-210	ENST00000469034	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	CDK8	P49336	464 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	KRTAP10-2	P60368	255 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	GAB4	Q2WGN9	574 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	CEP170	Q5SW79	1584 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	SASH1	O94885	1247 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	ETV3	P41162	512 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	SSPN	Q14714	243 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	NR0B2	Q15466	257 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	CELA3B	P08861	270 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	PLCB3	Q01970	1234 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	GPR160	Q9UJ42	338 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	KIF15	Q9NS87	1388 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	PTPRG	P23470	1445 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	PI3	P19957	117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	LTK	P29376	864 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	NFKB2	Q00653	900 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	DSC3	Q14574	896 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	IFT140	Q96RY7	1462 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	INSR	P06213	1382 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUMO1-210	ENST00000469034	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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