RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 Q96M66 194 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJC7Q99615 494 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 SV2CQ496J9 727 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 SHISA5Q8N114 240 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 PIM2Q9P1W9 311 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 TBX22Q9Y458 520 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 SHOXO15266 292 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP26A1O43174 497 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 SIGLEC6O43699 453 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRN2O75325 713 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CLCN7P51798 805 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 OXCT1P55809 520 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CEACAM5P06731 702 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 TNK2Q07912 1038 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 JMYQ8N9B5 988 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 BVESQ8NE79 360 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-205ENST00000462042 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 KDM2BQ8NHM5 1336 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR33A8MZF0 331 aa8.25□□□□□ -1.09
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RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF445P59923 1031 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 SPATC1Q76KD6 591 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.25□□□□□ -1.09
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RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CHST7Q9NS84 486 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 SRFP11831 508 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 GRIK1P39086 918 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 GRB10Q13322 594 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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RABGGTB-205ENST00000462042 LILRB2Q8N423 598 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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RABGGTB-205ENST00000462042 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 AKT3Q9Y243 479 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CLSTN1O94985 981 aa8.23□□□□□ -1.09
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RABGGTB-205ENST00000462042 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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RABGGTB-205ENST00000462042 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.23□□□□□ -1.09
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RABGGTB-205ENST00000462042 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR19A6NJB7 356 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 PRAMEF1O95521 474 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 ITGAVP06756 1048 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 POU4F1Q01851 419 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.22□□□□□ -1.09
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