RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 SCG2P13521 617 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 USTQ9Y2C2 406 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 MYOM2P54296 1465 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 DDAH1O94760 285 aa23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 UBE3CQ15386 1083 aa23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 MED23Q9ULK4 1368 aa23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 OR52Z1P0C646 297 aa23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD18B2RXH4 712 aa23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA8P51970 172 aa23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CCT6BQ92526 530 aa23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 DAPK3O43293 454 aa23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PHKG2P15735 406 aa23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CA8P35219 290 aa23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GPBP1Q86WP2 473 aa23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 VCX3BQ9H321 246 aa23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 TAF12Q16514 161 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 NEK8Q86SG6 692 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GPR108Q9NPR9 543 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 KCNQ3O43525 872 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CD19P15391 556 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF131P52739 623 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN26Q16670 478 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PNMA1Q8ND90 353 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 RABEP2Q9H5N1 569 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 AZI2Q9H6S1 392 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 I3L4J1 428 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 RNF40O75150 1001 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CDC25BP30305 580 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 DISP1Q96F81 1524 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GAS7O60861 476 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GEN1Q17RS7 908 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 P3H4Q92791 437 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8KD6RF30 607 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 NSMFQ6X4W1 530 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 TPH2Q8IWU9 490 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 RNF34Q969K3 372 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 SCRN1Q12765 414 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CPXCR1Q8N123 301 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 MED4Q9NPJ6 270 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A14Q15043 492 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF827Q17R98 1081 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK3O14649 394 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 TECP42680 631 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GSDMAQ96QA5 445 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PPP6R2O75170 966 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CRCPO75575 148 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 RASEFQ8IZ41 740 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D31Q96DN5 1066 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 KRIT1O00522 736 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 RASSF2P50749 326 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.29■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PDE6BP35913 854 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-201ENST00000284617 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms