RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 OXER1Q8TDS5 423 aa22.19■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.19■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 SCG2P13521 617 aa22.19■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 SLC16A2P36021 539 aa22.19■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 CCDC96Q2M329 555 aa22.19■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.19■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 USP48Q86UV5 1035 aa22.19■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 POTECB2RU33 542 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 F5H6K3 240 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 MMP1P03956 469 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 KLRC3Q07444 240 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 TRIM29Q14134 588 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 SLFN13Q68D06 897 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 HOMER1Q86YM7 354 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 BTBD18B2RXH4 712 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 NDUFB10O96000 172 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 NR5A1Q13285 461 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.17■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 EPHX2P34913 555 aa22.17■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 NPY5RQ15761 445 aa22.17■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.17■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 PIGSQ96S52 555 aa22.17■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 DOCK1Q14185 1865 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 TRAK2O60296 914 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 PRKG1Q13976 671 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 USP28Q96RU2 1077 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 ASNSP08243 561 aa22.15■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 SLC1A4P43007 532 aa22.15■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.15■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 KRT85P78386 507 aa22.14■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 DGKZQ13574 1117 aa22.14■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.14■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.14■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.14■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 TMX2Q9Y320 296 aa22.14■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 SCN4AP35499 1836 aa22.14■■□□□ 1.14
DUSP1-201ENST00000239223 FAM205CA6NFA0 338 aa22.14■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
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DUSP1-201ENST00000239223 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.14■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 GPT2Q8TD30 523 aa22.14■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 DCAF4Q8WV16 495 aa22.14■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 WRNIP1Q96S55 665 aa22.14■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.14■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 USP17L10C9JJH3 530 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 STXBP3O00186 592 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 POTEIP0CG38 1075 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 POTEJP0CG39 1038 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 DCAF15Q66K64 600 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 RGS22Q8NE09 1264 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 WDR90Q96KV7 1748 aa22.12■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 BRAPQ7Z569 592 aa22.12■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 SULF1Q8IWU6 871 aa22.12■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 GMCL1Q96IK5 515 aa22.12■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 SMARCA1P28370 1054 aa22.11■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 SNAP25P60880 206 aa22.11■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.11■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 BARHL2Q9NY43 387 aa22.11■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 CLIC4Q9Y696 253 aa22.11■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 OTOFQ9HC10 1997 aa22.11■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 KLRG1Q96E93 195 aa22.11■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.11■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.1■■□□□ 1.13
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM232C9JQI7 657 aa22.1■■□□□ 1.13
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